勉強も兼ねて代表的なフォーマットに対応したViewerを作成しています。
以前に作成した、MAX EDITORというテキストエディタを改造してエディタとして作成しようとも思ったのですが、データを変更する機会があまり感じられなかったので新規にViewerとして作成しています。
ファイル内容の表示が完成したらDBに格納したデータのViewerとして改造する予定です。
作成途中ですが現状の画面イメージは次のようになっています。
シーケンスの色が違うのはFEATURE部の情報に応じて表示が変化しているためです。
GenBankフォーマットもシーケンス部分だけを取り出すのは簡単ですが、Featureを解析するのが結構大変です。
Feature部の詳しいフォーマットについては下記に記載されています。
www.ncbi.nlm.nih.gov/collab/FT/index.html
この中でLocationの解析が処理の中心になると思います。
Locationの解析
